Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crmp1P97427 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crmp1P97427 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms