Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pkp1P97350 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms