Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx3P81067 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irx3P81067 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx3P81067 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx3P81067 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx3P81067 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms