Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf11P70378 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms