Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms