Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acta1P68134 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acta1P68134 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acta1P68134 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Acta1P68134 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Acta1P68134 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms