Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rps28P62858 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rps28P62858 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rps28P62858 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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