Protein–RNA interactions for Protein: P62342

Selenot, Thioredoxin reductase-like selenoprotein T, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenotP62342 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenotP62342 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SelenotP62342 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SelenotP62342 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SelenotP62342 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SelenotP62342 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SelenotP62342 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SelenotP62342 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelenotP62342 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SelenotP62342 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SelenotP62342 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SelenotP62342 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SelenotP62342 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SelenotP62342 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SelenotP62342 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SelenotP62342 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenotP62342 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenotP62342 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenotP62342 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenotP62342 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SelenotP62342 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenotP62342 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenotP62342 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenotP62342 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenotP62342 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenotP62342 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SelenotP62342 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SelenotP62342 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SelenotP62342 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SelenotP62342 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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