Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snrpd1P62315 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snrpd1P62315 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms