Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps13P62301 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps13P62301 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps13P62301 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps13P62301 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps13P62301 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps13P62301 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rps13P62301 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.1 ms