Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps11P62281 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps11P62281 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps11P62281 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps11P62281 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms