Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psme3P61290 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psme3P61290 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme3P61290 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme3P61290 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme3P61290 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme3P61290 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psme3P61290 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms