Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms