Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap25P60879 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snap25P60879 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snap25P60879 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snap25P60879 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms