Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps33bP59016 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps33bP59016 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps33bP59016 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms