Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tm6sf1P58749 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tm6sf1P58749 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms