Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxbp1P58501 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxbp1P58501 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxbp1P58501 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Paxbp1P58501 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Paxbp1P58501 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms