Protein–RNA interactions for Protein: P58355

Slc45a2, Membrane-associated transporter protein, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a2P58355 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc45a2P58355 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc45a2P58355 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc45a2P58355 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc45a2P58355 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc45a2P58355 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc45a2P58355 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc45a2P58355 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc45a2P58355 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc45a2P58355 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms