Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctbp2P56546 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms