Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rrp1P56183 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrp1P56183 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rrp1P56183 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rrp1P56183 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrp1P56183 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp1P56183 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms