Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a1P55014 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms