Protein–RNA interactions for Protein: P53776

Lhx4, LIM/homeobox protein Lhx4, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx4P53776 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lhx4P53776 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lhx4P53776 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms