Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux1P53564 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux1P53564 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux1P53564 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cux1P53564 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux1P53564 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux1P53564 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux1P53564 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux1P53564 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cux1P53564 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux1P53564 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cux1P53564 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms