Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ube2e3P52483 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e3P52483 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms