Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ClgnP52194 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClgnP52194 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClgnP52194 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms