Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms