Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfbP49766 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfbP49766 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfbP49766 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfbP49766 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfbP49766 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfbP49766 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfbP49766 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VegfbP49766 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VegfbP49766 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VegfbP49766 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfbP49766 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfbP49766 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfbP49766 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfbP49766 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VegfbP49766 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VegfbP49766 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfbP49766 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VegfbP49766 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms