Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk5P49615 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk5P49615 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms