Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
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PtpreP49446 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpreP49446 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PtpreP49446 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PtpreP49446 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpreP49446 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpreP49446 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtpreP49446 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms