Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ptx3P48759 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms