Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prox1P48437 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox1P48437 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox1P48437 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prox1P48437 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox1P48437 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prox1P48437 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms