Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpiaP47968 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RpiaP47968 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RpiaP47968 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RpiaP47968 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms