Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl5P47962 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl5P47962 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms