Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf1P46099 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf1P46099 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf1P46099 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf1P46099 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf1P46099 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf1P46099 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf1P46099 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf1P46099 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klf1P46099 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf1P46099 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klf1P46099 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms