Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr3P43300 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr3P43300 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr3P43300 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Egr3P43300 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Egr3P43300 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms