Protein–RNA interactions for Protein: P41731

Cd63, CD63 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd63P41731 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd63P41731 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd63P41731 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd63P41731 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd63P41731 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd63P41731 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd63P41731 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd63P41731 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd63P41731 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd63P41731 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd63P41731 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd63P41731 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd63P41731 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd63P41731 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd63P41731 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd63P41731 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd63P41731 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd63P41731 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd63P41731 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd63P41731 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd63P41731 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd63P41731 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd63P41731 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd63P41731 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd63P41731 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms