Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox7P40646 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox7P40646 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox7P40646 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms