Protein–RNA interactions for Protein: P38649

Abo, Histo-blood group ABO system transferase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AboP38649 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AboP38649 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AboP38649 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AboP38649 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AboP38649 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AboP38649 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AboP38649 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AboP38649 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AboP38649 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AboP38649 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AboP38649 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AboP38649 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AboP38649 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AboP38649 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AboP38649 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AboP38649 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AboP38649 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AboP38649 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AboP38649 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AboP38649 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AboP38649 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AboP38649 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AboP38649 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AboP38649 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AboP38649 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AboP38649 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AboP38649 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AboP38649 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
AboP38649 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
AboP38649 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
AboP38649 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AboP38649 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AboP38649 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AboP38649 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AboP38649 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AboP38649 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AboP38649 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AboP38649 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AboP38649 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AboP38649 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AboP38649 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AboP38649 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AboP38649 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AboP38649 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AboP38649 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms