Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TtlP38585 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TtlP38585 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TtlP38585 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TtlP38585 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtlP38585 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtlP38585 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtlP38585 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtlP38585 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtlP38585 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtlP38585 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtlP38585 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtlP38585 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtlP38585 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtlP38585 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtlP38585 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtlP38585 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TtlP38585 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TtlP38585 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtlP38585 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TtlP38585 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtlP38585 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TtlP38585 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtlP38585 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtlP38585 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtlP38585 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtlP38585 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtlP38585 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtlP38585 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtlP38585 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TtlP38585 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TtlP38585 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TtlP38585 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms