Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprkP35822 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprkP35822 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtprkP35822 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprkP35822 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprkP35822 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprkP35822 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PtprkP35822 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprkP35822 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprkP35822 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PtprkP35822 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PtprkP35822 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprkP35822 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PtprkP35822 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms