Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddit3P35639 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddit3P35639 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms