Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sftpa1P35242 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sftpa1P35242 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sftpa1P35242 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sftpa1P35242 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sftpa1P35242 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms