Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tfap2aP34056 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tfap2aP34056 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms