Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Notch4P31695 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Notch4P31695 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Notch4P31695 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Notch4P31695 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Notch4P31695 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Notch4P31695 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Notch4P31695 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Notch4P31695 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Notch4P31695 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Notch4P31695 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Notch4P31695 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Notch4P31695 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Notch4P31695 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Notch4P31695 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Notch4P31695 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Notch4P31695 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Notch4P31695 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Notch4P31695 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Notch4P31695 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Notch4P31695 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Notch4P31695 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Notch4P31695 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms