Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gsx2P31316 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gsx2P31316 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms