Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa2P31245 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa2P31245 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms