Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnd1P30999 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms