Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VtnP29788 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VtnP29788 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VtnP29788 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
VtnP29788 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VtnP29788 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VtnP29788 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VtnP29788 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VtnP29788 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VtnP29788 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VtnP29788 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VtnP29788 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VtnP29788 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VtnP29788 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VtnP29788 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VtnP29788 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VtnP29788 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VtnP29788 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VtnP29788 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VtnP29788 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms