Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpbP27790 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenpbP27790 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpbP27790 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CenpbP27790 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpbP27790 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpbP27790 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CenpbP27790 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenpbP27790 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms