Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CftrP26361 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CftrP26361 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CftrP26361 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CftrP26361 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CftrP26361 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CftrP26361 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CftrP26361 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CftrP26361 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CftrP26361 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CftrP26361 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CftrP26361 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CftrP26361 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CftrP26361 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CftrP26361 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CftrP26361 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CftrP26361 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CftrP26361 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CftrP26361 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CftrP26361 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CftrP26361 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CftrP26361 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CftrP26361 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CftrP26361 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CftrP26361 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CftrP26361 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CftrP26361 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CftrP26361 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CftrP26361 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CftrP26361 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CftrP26361 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CftrP26361 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CftrP26361 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CftrP26361 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CftrP26361 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CftrP26361 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CftrP26361 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CftrP26361 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CftrP26361 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CftrP26361 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CftrP26361 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CftrP26361 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CftrP26361 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CftrP26361 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CftrP26361 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CftrP26361 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CftrP26361 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CftrP26361 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CftrP26361 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CftrP26361 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CftrP26361 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CftrP26361 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CftrP26361 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CftrP26361 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CftrP26361 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CftrP26361 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CftrP26361 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CftrP26361 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CftrP26361 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CftrP26361 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CftrP26361 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CftrP26361 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CftrP26361 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CftrP26361 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CftrP26361 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CftrP26361 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CftrP26361 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CftrP26361 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CftrP26361 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CftrP26361 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CftrP26361 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CftrP26361 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CftrP26361 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CftrP26361 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CftrP26361 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CftrP26361 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CftrP26361 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CftrP26361 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CftrP26361 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CftrP26361 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CftrP26361 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CftrP26361 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CftrP26361 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CftrP26361 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CftrP26361 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CftrP26361 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CftrP26361 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CftrP26361 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CftrP26361 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CftrP26361 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CftrP26361 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CftrP26361 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CftrP26361 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CftrP26361 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CftrP26361 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CftrP26361 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CftrP26361 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CftrP26361 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CftrP26361 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CftrP26361 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms